南通附属医院小儿内科还不错，该院的小儿内科成立时间已经超过了五十多年，目前拥有高级职称16人，中级职称12人，博士生一人，硕士生9人，该科室还分为血液、肾脏、新生儿、神经、心血管、呼吸、内分泌、、消化、急救、儿童保健等专业组，并有相应的专科门诊，拥有着非常先进的医疗设备。
南通附属医院（通大附院）儿科在医疗、教学、科研等各方面在南通地区乃至整个苏北地区，起到一个领头羊、排头兵作用，在儿科专科特色优势明显：
1、专科特色
每年有无数例濒临**边缘的患儿，在通大附院儿科经过积极抢救得以再生，如重症心肌炎伴阿—斯发作、重症脑炎、高血压脑病、感染性休克、呼吸衰竭、心力衰竭、糖尿病酮症酸中毒、高渗性昏迷、药物毒物中毒等。
2、学科优势
儿科教研室担负着繁重的教学任务，教学质量得到各方面赞誉，多次被医学院乃至交通部评为“先进教研室”。
3、成绩斐然
儿科各专业组成绩斐然，有3位白血病患儿在这里得到治好，率先开展先心介入治疗等;建立“儿童哮喘之家”、“儿童多动症俱乐部”，具有**的儿科实验室，承担和完成多名研究生课题，目前开展的新项目有血降钙素原测定、**学检测、过敏原检测等，为临床诊断疾病提供有力依据。
